Основные направления научной деятельности • Изучение молекулярных механизмов устойчивости и толерантности микроорганизмов к противомикробным препаратам.
• Поиск биомаркеров, ассоциированных с развитием аутоиммунных, нейродегенеративных, онкологических патологий, и разработка эффективных методов их обнаружения.
• Разработка и регистрация как медицинских изделий для диагностики in vitro наборов реагентов для идентификации ДНК и белковых маркеров социально-значимых заболеваний.
Основные научные достижения • Разработан и регистрируется как медицинское изделие уникальный диагностический тест - Набор реагентов «БИОЧИП-А» для определения генетических маркеров риска развития болезни Альцгеймера. Первая валидация полигенной модели риска развития болезни Альцгеймера в российской популяции показала, что значения IV квартиля полигенного риска и аллель ε4 гена аполипротеина E, определяемые на биочипе, являются достоверными маркерами повышенного риска развития болезни Альцгеймера.
• Разработаны новые гидрогелевые биочипы для выявления геномных маркеров, ассоциированных с устойчивостью возбудителя туберкулеза к актуальным противотуберкулезным препаратам.
• Предложен оригинальный метод молекулярного типирования возбудителя гонококковой инфекции Neisseria gonorrhoeae, выявлены микроэволюционные события в геноме возбудителя, характеризующих развитие его устойчивости к противомикробным препаратам.
• Разработан и регистрируется как медицинское изделие Набор реагентов «NG-ТЕСТ» для обнаружения генетических детерминант устойчивости N. gonorrhoeae к цефтриаксону – основному препарату для терапии гонококковой инфекции.
• Для глобальной популяции возбудителя гонококковой инфекции выявлена ассоциация между снижением его чувствительности к антибиотикам и функциональностью гонококкового генетического острова, кодирующего систему секреции ДНК IV типа.
• Установлены высокоспецифичные сывороточные маркеры – аутоантитела против интерферонов I типа и интерлейкина-22, характеризующие развитие аутоиммунного орфанного заболевания – аутоиммунного полигландулярного синдрома I типа.
Международные научные связи Ведущий научный сотрудник, к.б.н. Данила Вадимович Зименков – участник ключевых международных консорциумов по изучению лекарственно-устойчивого туберкулеза CRyPTIC Consortium и the Seq&Treat Consortium | 
